在完善合作机制平台方面，《协议》明确用好泛珠三角区域合作机制。深化拓展泛珠三角区域合作框架下双边与多边合作，推动泛珠三角区域合作行政首长联席会议粤川高层会晤制度化，依托联席会议平台，促进两省交流会商常态化；协同推进泛珠高铁经济带合作。加快共建粤桂黔滇川高铁经济带，用好泛珠区域高铁经济带联席会议机制，促进相关市州、产业园区和产业联盟等不同主体间的多层次、全方位合作。
在提升互联互通水平方面，《协议》明确协同发展铁海联运。推动成都国际铁路港、宜宾港、泸州港等内陆港口与广州南沙港、湛江港等出海港口联动发展，强化货源组织与物流聚集，稳定开行南向铁海联运班列。共同打造蓉粤铁海联运班列品牌，推动构建连接“东盟-欧洲”的“蓉粤+蓉欧”国际中转大通道；深化航空领域合作。推进成都国际航空枢纽与粤港澳大湾区机场群协同发展，共同开辟国际航空市场。支持两省机场间新开、加密直飞航线航班。加强航空货运合作，支持南方航空公司等在四川设立全货运基地航空公司；推动交通运输管理合作。加强交通强省建设交流合作，推进交通运输科技创新、综合交通运输信息平台建设、既有交通设施智能化提升等方面协作联动，共同提升交通基础设施、交通管理等方面智能化程度。
在深化产业协作方面，《协议》明确共同推动优势制造业发展。加强电子信息、装备制造、食品饮料、先进材料、能源化工等重点优势产业对接，开展产业链配套协作，促进产业组团式承接和集群式发展，共同增强产业链供应链自主可控能力。支持广安（深圳）产业园、甘眉工业园等园区提质增效，促进一批开发（园）区交流合作、互设飞地园区。
共同推进特色农业发展。加快两省果蔬、茶叶、中药材等特色农业交流合作，支持特色农产品精深加工产业创新发展，共同推动种养加一体、一二三产业融合发展。共建粤港澳大湾区“菜篮子”生产基地，打造具有国际影响力的农产品品牌。
推进文化旅游合作。推动两省文旅资源共享，共同举办文旅推介活动，联合策划推广精品旅游线路、打造生态康养基地。加强两省旅游企业交流合作，鼓励跨省经营、连锁经营和品牌联合输出，扩大入境游规模。支持两省文化机构和社会组织等开展双向交流活动，深化民族间交往交流交融。开展考古文化比较研究，共同推进中华文化标志性资源保护和利用。
强化金融合作。推动符合条件的金融机构以参股、控股、兼并重组等方式参与两省地方金融改革，鼓励互设分支机构，共同推进金融业创新发展。探索开展碳汇交易试点，加强碳达峰、碳中和等方面合作。支持四川企业在深交所上市或发行债券融资，拓宽融资渠道。
在推进科技创新合作方面，《协议》明确推动创新平台合作。加强国家重点实验室、高校科研院（所）及行业龙头企业交流合作，促进两省产业发展与科研创新成果的融合。进一步深化省校合作。推动成渝（兴隆湖）综合性科学中心、西部（成都）科学城、中国（绵阳）科技城等与大湾区综合性国家科学中心（光明科学城片区、松山湖科学城片区、南沙科学城片区）等建立定期交流互访合作机制。积极推动中国科学院深圳先进技术研究院在川设立分支机构。
支持科创资源开放共享。完善区域科技合作创新网络建设，推动两省国家（省级）工程（技术）研究中心、工程实验室、企业技术中心、大型仪器等创新资源的开放共享。推动两地互列院士专家工作站，支持两地互派专家参与科技项目评审和科技奖励评审，加强两地科技人才、科创企业家的流动合作。
在推动公共服务合作方面，《协议》明确加强教育医疗合作。鼓励两省院校资源合作，在跨省招生计划上互相支持，加强两省中小学教师和管理骨干培训交流。建立两省突发公共卫生事件应急处置协作、卫生监督和传染病联防联控机制，支持两省选派临床重点专科团队、监督执法人员到对方医疗卫生机构、卫生监督执法机构进修学习。
深化劳务协作。建立劳动力供需信息交流制度，搭建用工对接供需信息平台，持续开展劳务对接、信息共享，做好有组织劳务输出。
加强“放管服”改革协作。推动户籍、居民身份证、养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险等高频政务事项“跨省通办”。推动两省市场执法监管部门加强信息互换、执法互助、监管互认，深化粤川知识产权保护协作。
“现在主要是利用好现有平台，后续再进一步深化一些合作内容。”四川省发展改革委相关负责人介绍，《协议》主要是延续以前东西部协作的合作机制，用好现有的泛珠三角区域合作机制，在此基础上，从一些重点领域，比如基础设施、产业合作、科技创新等方面入手，转向粤川两省全面的战略合作。