在规划《建议》部署的12方面重大任务中，“坚持创新驱动发展，全面塑造发展新优势”列在首位。规划《建议》对创新发展进行四方面系统部署，包括强化国家战略科技力量，提升企业技术创新能力，激发人才创新活力和完善科技创新体制机制。
其中，在强化国家战略科技力量方面，我国将制定科技强国行动纲要，健全社会主义市场经济条件下新型举国体制，打好关键核心技术攻坚战，提高创新链整体效能。加强基础研究、注重原始创新，优化学科布局和研发布局，推进学科交叉融合，完善共性基础技术供给体系。瞄准人工智能、量子信息、集成电路、生命健康、脑科学、生物育种、空天科技、深地深海等前沿领域，实施一批具有前瞻性、战略性的国家重大科技项目。
在提升企业技术创新能力方面，我国将发挥企业家在技术创新中的重要作用，鼓励企业加大研发投入，对企业投入基础研究实行税收优惠。发挥大企业引领支撑作用，支持创新型中小微企业成长为创新重要发源地，加强共性技术平台建设，推动产业链上中下游、大中小企业融通创新。
在激发人才创新活力和完善科技创新体制机制方面，我国将健全创新激励和保障机制，构建充分体现知识、技术等创新要素价值的收益分配机制，完善科研人员职务发明成果权益分享机制。同时，改进科技项目组织管理方式，实行“揭榜挂帅”等制度。加大研发投入，健全政府投入为主、社会多渠道投入机制，加大对基础前沿研究支持。促进科技开放合作，研究设立面向全球的科学研究基金。